Search Results

这周学习了TME去卷积的原理和方法等内容，了解了TME去卷积相关函数的参数以及含义，读了些文献

本周工作总结 1.学习培养细胞，进行细胞传代 2.完善综述框架 下周工作计划 1.继续培养细胞 2.开始文献综述撰写

6月第四周（24-30） 一.上周处于积极复习备考 二.工作计划： 1.阅读领域内综述，对文章大纲进行归纳总结 2. 学习转座子基本知识 3.看生信技能树相关基础，系统性学习一下用count2rpkm算基因长度

本周工作小结 1.sclc方向：（1）组学相关文献整理：目前已整理13篇（已根据上周组会意见统一数据格式，明确可下载的组学及临床生存数据，另需申请数据已注明）； （2）已将每篇文献组学数据和临床数据下载，整理中 （3）组学文献系列汇报整理：将整理出的文献分为5个大方向进行总结（阅读学习中，未完成） 2.本院sclc随访数据整理，已随访完第一遍（561人） 3.本科大创学习安排：（1）下周二线下会议已安排；（2）已获得项目组-何生源（charls数据库）本周线上课程学习中，预计下周实践操作，复现文献；（3）邓博丹...

本周工作内容 1. 正文1 2. 正文2 下周工作计划 1.内容1 2.内容2

本周工作小结 1.复习备考 下周工作计划 1.补充完善cfNA相关笔记 2.复习备考

本周所得： 处理毕业相关事宜 指定暑期计划，做好规划 阅读bioinformatics data skills，了解该书的对应人群，章节目录和大体框架 阅读王老师推的博士毕业论文，了解肿瘤突变负荷，PD-1抗体等一些基础概念 下周计划： 参加毕业典礼，准备搬家 阅读bioinformatics data skills，开始学习基础知识 3.继续阅读王老师推的博士毕业论文

本周所得： 继续阅读博士毕业论文，理解了研究要做什么为什么要做 办理离校毕业手续，参加毕业典礼领取双证 下周计划： 搬宿舍 阅读毕业论文，深入了解其研究内容 阅读bioinformatics data skills 本周不足： 临近毕业繁琐事比较多，推进缓慢，静不下心看书，希望忙完搬家等毕业事宜后能静下心来，暑期一定要有所收获！ 若将爱视为交易，亲密关系终将沦为冰冷的契约---------------------------------------《爱的艺术》弗洛姆

这周学习了IOBR签名评分和相关表型的部分，主要内容为签名估计，结合得分数据和表型数据，识别与生存相关的特征，聚焦目标特征的分析，生存分析及可视化，时效性 ROC 曲线，批次相关性分析等。读了20篇左右文献，开始初步尝试在IOBR的基础上构建shiny可视化界面。

本周工作总结 1.做实验 SD大鼠灌胃（听说用下端略弯的灌胃针会更好或者说更常见，更契合实验动物的生理结构）。 我们用的灌胃针 大鼠腹部肿胀，触摸感觉略硬，是便秘的表现（不一定是怀孕，要区别），可能需要手动辅助排便（帮它挤出来），大鼠便秘一定时间且未得干预则致死。 2.复习、考试 截至7.6日本学期考试安排已全部完成。 下周工作计划 1.练习之前BLCA的代码 2.学习蛋白组的课程 3.完成团委“三下乡”相关活动工作 附录 用markdown语法插入的...

本周工作总结 1.复苏细胞，继续细胞传代，学习划痕实验原理 2.完成综述的摘要和背景部分 下周工作计划 1.动手做划痕实验 2.阅读相关文献，开始正文部分

1.sclc方向：（1）组学相关文献整理：整合临床数据（共5个队列），根据有生存数据的队列整理组学数据；（2）ASCO会议摘要学习整理（未完成） 2.本科大创学习安排：（1）数据库学习已安排对应学生学习：何生源-charls数据库；吴诗凡-NHANES数据库，李兴- GBD数据库，吴睿- MIMIC数据库 下周工作计划 1。初步整理及分析SCLC文献临床和组学数据，另筛选和整理ASCO会议SCLC方向摘要 2.继续完成文献系列总结

本周工作总结 1.在本周细胞培养实验中，观察到细胞增殖缓慢，培养至预定时间后细胞密度仍未达到预期水平，因此，增加血清的比例重新配制了培养基，但培养效果仍未改善。分析其中原因可能是由于分装血清时，冻存的血清尚未完全解冻。接下来，将按标准流程重新分装血清，配制新的培养基，进行细胞复苏培养。 2.阅读了以下几篇文献，开始撰写可变剪接的分子机制部分，但尚未完成该部分的工作。 下周工作计划 1.继续培养细胞。 2.继续文章的撰写，完成可变剪接的分子机制部分。

本周所得： 阅读博士毕业论文，了解其研究内容 搬宿舍 下周计划： 学习维护网站 继续阅读毕业论文，深入了解其研究内容 阅读bioinformatics data skill Mark和分享推荐文章 天行健，君子以自强不息-------------《周易》

1.工作总结：这周主要完成了shiny学习网站上的学习和实践，主要是前五课：对之前基础shiny的应用和回顾，读到了之前没有接触到的很关键的一部分，就是如何加载 R 脚本、软件包和数据集来创建更复杂的 Shiny 应用程序，关系到如何把数据，r包里面的函数和shiny界面结合在一起，之前对这个部分比较疑惑，同时里面的练习也对我掌握shiny的编写有很大帮助，加深了我对一些细节的理解。读了10几篇文献。 2.下一步计划：继续shiny网站的学习和实践，阅读gpsadb设计的源码，同时尝试使用具体的函数编写shiny程...

6.30-7.6 这周主要学习了TME相互作用分析相关的内容，看了20多篇文献，这周帮我妹妹研究高考报考的事情，以及回家之后有点怠惰，自己有点放松过头了，没怎么进行实践。下一步的计划还是以实践为主吧，学习怎么把shiny应用到IOBR的函数上面。

本周工作小结 1.sclc方向： （1）组学相关文献数据整理：临床数据处理，根据不同队列以队列名称+序号新增ID列；将相同意义的列名合并（进行中，某些列需返回文献明确，明确后且合并的列名在临床数据表格sheet2中注明） （2）ASCO会议摘要学习整理：1）大多数聚焦于DDL3，包括靶向 DLL3 的ADC，2）靶向B7-H3的ADC；3）HIF1A⁺Mφ在形成免疫抑制性TME中发挥关键作用； （3）SCLC随访数据，剩余200人因2月-3月完成第一次随访，本次进行每3个月的定期随访 2.本科大创学习安排：何...

本周工作总结 1.练习代码 练习之前BLCA做cox曲线的代码。 还是在之前数据读取的地方存在问题（修改表的排布适应后续代码），再仔细理解一下后面的代码试试看能不能改好。 2.了解蛋白质组学 之前看过的基础知识有点遗忘，从头开始重新看了，目前看到第四节。（资料是生信技能树几年前发过的公众号文章） 3.随校团委进行“三下乡”相关活动 下周工作计划 1.练习之前BLCA的代码 2.学习蛋白组的课程 3.完成团委“三下乡”相关活动工作

本周工作小结 1.sclc方向： 组学相关文献数据整理：临床数据已整合，针对治疗信息进行筛选后合并；有生存数据的接受免疫治疗患者共176人，其他治疗的368，但存在某些队列生存数据缺乏status；确认无为可定义放疗联合免疫的数据。 2.伦理申请：1）重庆一般项目和回顾性研究伦理申请已完成；2）贝伐联合阿美及青年医学项目正在完善，另因提交伦理需同时提交研究方案，再次检查并完善方案。 3.本科项目：1）何生源charls组拟实际操作（已给R包安装账号和密码）；（2）邓博丹文章根据本周组会意见修改后再返回； （3）李...

本周工作总结 1.细胞传代（A549,EB） 2.撰写可变剪接分子机制部分 下周工作计划 1.将A549细胞和EB细胞设置为实验组和对照组，做划痕实验 2.由于初次撰写文献综述，写作思路存在一定的问题，接下来将重新开始文章的撰写工作，同时在写作过程中同步补充和引用相关文献