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6月第二周6.9-6.15

大三乾洪倩 2025

6.9-6.15 这周学习了shiny的第22.23章,主要内容是一些保护 Shiny 应用的基础知识,精确测量和提升任何 Shiny 应用性能的工具。读了些文献,了解了一些IOBR肿瘤微环境的...

Updated 1 month ago by 乾洪倩

项目成果列表

团队公开信息指南

针对团队项目成果的汇总整理。 数据库/平台 UCSCXenaShiny V2: https://shiny.hiplot.cn/ucsc-xena-shiny/, GitHub repo,...

Updated 2 months ago by 周建国

王诗翔

团队公开信息指南 团队成员

Shixiang Wang I am a computational biologist working on cancer genomics. I use bioinformatics ski...

Updated 5 months ago by 王诗翔

OncoHarmony团队架构

团队公开信息指南

初心 协作贡献、共同成长、皆有所得。 团队结构 负责人1:周建国,主要负责计算平台、资金、文稿和监管 负责人2:王诗翔,主要负责项目管理、技术路线、部署运维 科研助理:徐俊祝【负责发票、财务及...

Updated 7 months ago by 王诗翔

Docker和Singularity的使用

团队笔记 笔记博客

参考:https://shixiangwang.github.io/posts/2024-02-23-use-singularity/ 如何在服务器上构建 singularity 容器文件...

Updated 7 months ago by 王诗翔

崔炎濡

团队公开信息指南 团队成员

Yanru Cui I am a researcher with a background in gene editing, molecular biology, and biomedical ...

Updated 8 months ago by Yanru Cui

李申锁

团队公开信息指南 团队成员

Shensuo Li I am a PhD student from Sichuan University, currently interested in researching the ap...

Updated 8 months ago by 李申锁

原始数据检索与整理

DNA项目 📊数据资源

Updated 10 months ago by 王诗翔

使用conda时的一些问题

团队笔记 笔记博客

刚安装完成 miniconda3,就无法启动 Python $ which python ~/miniconda3/bin/python $ python Segmentation fault...

Updated 10 months ago by 王诗翔

基因注释数据中的点.号,表示不同的版本

团队笔记 笔记博客

在处理 GTF 等基因注释数据(特别是非编码区域,如假基因)时发现 gene symbol 中存在点号,一般而言,这种是表示不同的版本,但奇怪的是不同的名字居然有不同的 ENSEMBL Gene...

Updated 10 months ago by 王诗翔

「6」临床指南与标志物研究

团队笔记 学习任务

临床指南 BEST 标志物研究

Updated 1 year ago by 王诗翔

「5」StatQuest

团队笔记 学习任务

学习时间:自定义 学习材料 StatQuest 介绍了非常多统计和生信相关的理论知识,生动形象,大家可以根据自己的兴趣全面/有选择性地学习。如果自己有梯子能上外网可以上 Youtube 看...

Updated 1 year ago by 王诗翔

Welcome

团队公开信息指南

OncoHarmony Network is a dynamic collaborative platform dedicated to advancing the frontier of c...

Updated 1 year ago by 王诗翔

Shiny-Apps

团队公开信息指南

团队开发和运维的 Shiny 应用。 Apps TCCIA: http://shiny.zhoulab.ac.cn/TCCIA UCSCXenaShiny: https://shiny.z...

Updated 1 year ago by 王诗翔

周建国

团队公开信息指南 团队成员

Jian-Guo Zhou I am a Deputy Chief Physician (Master Thesis Supervisor) of Zunyi Medical Universit...

Updated 1 year ago by 周建国

「4」common online tools

团队笔记 学习任务

全职学习时间:1-4 周 学习材料 自身了解的一些对初学者有益的生物医学在线生物信息工具: Sandbox.bio 是一个生物信息学沙盒平台,允许用户在安全隔离的环境中运行生物信息学实验。它...

Updated 1 year ago by 王诗翔

「3」Snakemake

团队笔记 学习任务

全职学习时间:1-2 周 学习材料 Snakemake教程 补充阅读笔记 snakemake 教程精要 任务 阅读学习材料,并在本地或者利用免费的 GitPod在云端按照教程...

Updated 1 year ago by 王诗翔

「2」Unix基本操作与ggplot可视化概览

团队笔记 学习任务

全职学习时间:2 周 学习材料 The Unix Workbench Learning-Markdown (Markdown 入门参考) 补充阅读 A Gentle Guide ...

Updated 1 year ago by 王诗翔

「1」R与Shiny

团队笔记 学习任务

全职学习时间:2 周 学习材料 R for Data Science Mastering Shiny 补充阅读 Shiny 开发学习路径 任务 利用 Shiny 模拟 TC...

Updated 1 year ago by 王诗翔

网页路由和shiny.router使用方法

团队笔记 教程

作者:赵彦昆 什么是路由? 路由描述的是 URL 与 UI 之间的映射关系,这种映射是单向的,即 URL 变化引起 UI 更新(无需刷新页面)。 route 和router区别 route...

Updated 1 year ago by 王诗翔